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Nextflow 로 작성된 라이브러리
rnaseq
STAR, RSEM, HISAT2 또는 Salmon을 유전자/이소형 계수 및 광범위한 품질 관리와 함께 사용하는 RNA 시퀀싱 분석 파이프라인..
646
MIT
patterns
선별된 Nextflow 구현 패턴 모음(nextflow-io 제공).
281
MIT
sarek
WGS/표적 시퀀싱에서 생식계열 또는 체세포 변이(전처리, 변이 호출 및 주석)를 감지하기 위한 분석 파이프라인.
256
MIT
chipseq
ChIP-seq 피크 호출, QC 및 차등 분석 파이프라인..
149
MIT
atacseq
ATAC-seq 피크 호출 및 QC 분석 파이프라인.
142
MIT
mag
metagenomes의 조립 및 비닝.
134
MIT
eager
완벽하게 재현 가능한 최첨단 고대 DNA 분석 파이프라인.
96
MIT
configs
다른 기관의 컴퓨팅 환경에 특정한 매개변수를 정의하는 데 사용되는 구성 파일(nf-core 기준).
71
MIT
rnaseq-nf
RNAseq 파이프라인의 개념 증명.
53
Mozilla Public License 2.0
rare-disease-wf
(WIP) 희귀 질환에 대한 모범 사례 워크플로.
51
MIT
hlatyping
차세대 시퀀싱 데이터의 정밀 HLA 유형.
45
MIT
rnatoy
Nextflow를 사용한 개념 증명 RNA-Seq 파이프라인.
28
GATK
GATK4 모범 사례를 기반으로 한 생식계열 변이 호출 Nextflow 파이프라인.
11