Nextflow 로 작성된 라이브러리

rnaseq

STAR, RSEM, HISAT2 또는 Salmon을 유전자/이소형 계수 및 광범위한 품질 관리와 함께 사용하는 RNA 시퀀싱 분석 파이프라인..
  • 646
  • MIT

patterns

선별된 Nextflow 구현 패턴 모음(nextflow-io 제공).
  • 281
  • MIT

sarek

WGS/표적 시퀀싱에서 생식계열 또는 체세포 변이(전처리, 변이 호출 및 주석)를 감지하기 위한 분석 파이프라인.
  • 256
  • MIT

chipseq

ChIP-seq 피크 호출, QC 및 차등 분석 파이프라인..
  • 149
  • MIT

atacseq

ATAC-seq 피크 호출 및 QC 분석 파이프라인.
  • 142
  • MIT

mag

metagenomes의 조립 및 비닝.
  • 134
  • MIT

eager

완벽하게 재현 가능한 최첨단 고대 DNA 분석 파이프라인.
  • 96
  • MIT

configs

다른 기관의 컴퓨팅 환경에 특정한 매개변수를 정의하는 데 사용되는 구성 파일(nf-core 기준).
  • 71
  • MIT

rnaseq-nf

RNAseq 파이프라인의 개념 증명.
  • 53
  • Mozilla Public License 2.0

rare-disease-wf

(WIP) 희귀 질환에 대한 모범 사례 워크플로.
  • 51
  • MIT

hlatyping

차세대 시퀀싱 데이터의 정밀 HLA 유형.
  • 45
  • MIT

rnatoy

Nextflow를 사용한 개념 증명 RNA-Seq 파이프라인.
  • 28

GATK

GATK4 모범 사례를 기반으로 한 생식계열 변이 호출 Nextflow 파이프라인.
  • 11